Наразі до складу університету входить 26 факультетів та навчально-наукових інститутів: біологічний; геології, географії, рекреації та туризму; економічний; іноземних мов; історичний; комп’ютерних наук; математики і інформатики; медичний; міжнародних економічних відносин та туристичного бізнесу; психології; радіофізики, біомедичної електроніки та комп’ютерних систем; соціологічний; фізичний; філологічний; філософський; хімічний; юридичний; ННІ екології; ННІ «Інститут державного управління»; ННІ «Каразінський банківський інститут»; ННІ «Каразінська школа бізнесу»; ННІ комп’ютерної фізики та енергетики; ННІ «Фізико-технічний факультет», ННІ «Українська інженерно-педагогічна академія», навчально-науковий професійно-педагогічний інститут (м. Бахмут), Кадіївський навчально-науковий інститут гірничих та освітніх технологій.
Підготовка фахівців у Харківському національному університеті імені В. Н. Каразіна здійснюється за 115 спеціальностями та спеціалізаціями, охоплює весь спектр сучасної класичної університетської освіти.
Щорічно студентами університету стають абітурієнти, серед яких близько 30 % — медалісти та 10 % — призери третього і четвертого етапів Всеукраїнських учнівських олімпіад.
Університет є одним із найбільших наукових центрів України. У ньому представлені практично всі напрямки сучасної фундаментальної науки. До складу університету входять НДІ хімії, НДІ біології, НДІ астрономії.